Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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