Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vps8Q0P5W1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms