Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc7a1Q09143 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc7a1Q09143 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms