Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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