Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms