Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnn2Q08093 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms