Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Cnn1Q08091 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cnn1Q08091 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Cnn1Q08091 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cnn1Q08091 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Cnn1Q08091 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms