Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprgQ05909 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprgQ05909 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms