Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpd1Q04519 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms