Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs2Q03350 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs2Q03350 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs2Q03350 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs2Q03350 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs2Q03350 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs2Q03350 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs2Q03350 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs2Q03350 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs2Q03350 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Thbs2Q03350 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs2Q03350 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms