Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Aplp1Q03157 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Aplp1Q03157 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms