Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms