Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col6a2Q02788 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col6a2Q02788 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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