Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb4Q02738 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb4Q02738 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms