Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GscQ02591 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GscQ02591 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GscQ02591 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GscQ02591 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms