Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp1Q01514 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms