Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HmgcrQ01237 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms