Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms