Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb2Q00977 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb2Q00977 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms