Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga4Q00651 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga4Q00651 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga4Q00651 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga4Q00651 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga4Q00651 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms