Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gabpb1Q00420 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gabpb1Q00420 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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