Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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