Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcc1P97496 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcc1P97496 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcc1P97496 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcc1P97496 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcc1P97496 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcc1P97496 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcc1P97496 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms