Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms