Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Npas2P97460 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npas2P97460 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Npas2P97460 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npas2P97460 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Npas2P97460 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npas2P97460 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npas2P97460 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npas2P97460 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npas2P97460 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms