Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1bP97358 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms