Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx1P83917 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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