Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprn2P80560 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ptprn2P80560 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptprn2P80560 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms