Protein–RNA interactions for Protein: P80315

Cct4, T-complex protein 1 subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct4P80315 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct4P80315 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct4P80315 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct4P80315 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct4P80315 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms