Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms