Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CiitaP79621 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms