Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctps1P70698 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms