Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tp53bp1P70399 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tp53bp1P70399 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms