Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SeboxP70368 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms