Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smad1P70340 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms