Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gfi1P70338 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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