Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp7P70280 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms