Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd13P70217 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms