Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcbP68404 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms