Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rps3P62908 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms