Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Snrpd1P62315 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snrpd1P62315 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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