Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rps11P62281 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps11P62281 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rps11P62281 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rps11P62281 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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