Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch1P62046 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms