Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Tmem258P61166 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -1
Tmem258P61166 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms