Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ppfia3P60469 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia3P60469 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms