Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp1P60335 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms