Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tpm2P58774 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms