Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uchl4P58321 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl4P58321 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms