Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cldn18P56857 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cldn18P56857 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cldn18P56857 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cldn18P56857 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cldn18P56857 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cldn18P56857 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cldn18P56857 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cldn18P56857 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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