Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SmoP56726 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SmoP56726 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SmoP56726 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmoP56726 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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